关于大规模数据操作

  大规模数据操作牵扯到效率以及计算机硬件资源占用的问题，当然，这两个指标是鱼与熊掌的关系。
但是，通过对数据的提前预处理，我们可以在一定程度上将鱼与熊掌得兼。
常用的预处理方法：
一，多维排序并创建索引。
将数据按照一定的层次排序，每个层次内部按照某一个指标再排序，同时，再排序过程中生成一个记录每个层次位置的索引表。
二，利用现有格式
关于利用已经有资源的情况已经不知一次被重申并且强调。
现有的大规模基因组相关数据格式有：GTF，GFF等等

posted on 2011-11-29 15:42 ewre 阅读(208) 评论(0)  编辑 收藏 引用 所属分类: Bioinformatics


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