Windows的自启动方式：
一.自启动目录：
1.第一自启动目录：
默认路径位于：
C:\windows\start menu\programs\startup（English）
C:\windows\start menu\programs\启动（Chinese）
这是最基本、最常用的Windows启动方式，主要用于启动一些应用软件的自启动项目，如Office的快捷菜单。一般用户希望启动时所要启动的文件也可以通过这里启动，只需把所需文件或其快捷方式放入文件夹中即可。
对应的注册表位置：
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Shell Folders]
Startup=\"%Directory%\"
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\User Shell Folders]
Startup=\"%Directory%\"
其中“%Directory%”为启动文件夹位置。
英文默认为：
C:\windows\start menu\programs\startup
中文默认为：
C:\windows\start menu\programs\启动
在开始菜单的“启动”文件夹是可更改的，如果用户更改了启动文件夹，则以上注册表的键值均会改变为相应的名称。
值得注意的是：开始菜单的“启动”文件夹中的内容虽然在默认的状态下可以被用户看得一清二楚。但通过改动还是可以达到相当隐蔽地启动的目的的：
首先，“启动”文件夹中的快捷方式或其他文件的属性可以改变为“隐藏”。这样可以达到系统不启动被隐藏的文件，等到需要启动的时候又可以通过更改回文件属性而恢复启动的作用。
其次，其实“启动”文件夹只是一个普通的文件夹，但是由于系统监视了这个文件夹，所以变得有些特殊，但文件夹有的功能该文件夹也是有的。譬如“启动”文件夹的名称是可以更改的，并且“启动”文件夹也可以设置属性。如果把属性设置为“隐藏”，则在系统中的【开始】【程序】菜单中是看不到“启动”文件夹的（即使在“文件夹选项”中已经设定了“显示所有文件”）。而系统还会启动这个被隐藏的文件夹中的非隐藏文件。
敏感的人们也许已经发现问题。举一个例子：
如果我想启动A木马的server端服务器，我可以把原来的“启动”菜单的名称更改为“StartUp”（这里是随便改的，注册表相应的键值也会自动更改。）之后再创建一个名为“启动”的文件夹，把“StartUp”菜单中的文件全部复制（这里用复制，可以骗过用户的检查）到“启动”菜单中，然后把A木马的server程序放入“StartUp”文件夹中，最后把“StartUp”文件夹隐藏。大功告成！
从外表看来，用户的【开始】【启动】目录还在，而且要启动的文件也在。但系统此时启动的文件不是名为“启动”的文件夹中的文件，而是名为“StartUp”的文件夹中的文件。如果木马做的好的话，完全可以在每次启动的时候把“StartUp”中的文件复制到“启动”目录中来达到实时更新启动目录的目的。由于“StartUp”文件夹被隐藏，从【开始】【程序】中是无法看到真正的启动菜单“StartUp”的，所以达到了隐蔽启动的目的！
这个启动方式虽然比较隐蔽，但通过msconfig依旧可以在“启动”页中看出来。
2.第二自启动目录：
是的，其实，Windows还有另外一个自启动目录，而且很明显但却经常被人们忽略的一个。
该路径位于：
C:\WINDOWS\All Users\Start Menu\Programs\StartUp（English）
C:\WINDOWS\All Users\Start Menu\Programs\启动（Chinese）
这个目录的使用方法和第一自启动目录是完全一样的。只要找到该目录，将所需要启动的文件拖放进去就可以达到启动的目的。
[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\explorer\User Shell Folders]
\"Common Startup\"=\"%Directory%\"
[HKEY_LOCAL_MACHINE\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\explorer\Shell Folders]
\"Common Startup\"=\"%Directory%\"
值得注意的是：该目录在开始菜单的“启动”目录中是完全不能被看见的。而伴随着每次启动，该目录下的非隐藏文件也会随之启动！ 另外，在Msconfig中可以看到在这个目录下要启动的文件。
二.系统配置文件启动：
由于系统的配置文件对于大多数的用户来说都是相当陌生的；这就造成了这些启动方法相对来说都是相当隐蔽的，所以这里提到的一些方法常常会被用于做一些破坏性的*作，请读者注意。
1.WIN.INI启动：
启动位置（file.exe为要启动的文件名称）：
[windows]
load=file.exe
run=file.exe
注意：load=与run=的区别在于：通过load=运行文件，文件会在后台运行（最小化）；而通过run=来运行，则文件是在默认状态下被运行的。
2.SYSTEM.INI启动：
启动位置（file.exe为要启动的文件名称）：
默认为：
[boot]
Shell=Explorer.exe
可启动文件后为：
[boot]
Shell=Explorer.exe file.exe
说明：
笔者记得在诺顿先生（就是开发出Norton系列软件的人）写的一本书里面曾经说过，1、2这两个文件的有无对系统没有什么影响，但由于时间的关系，笔者没有来得及试验，有兴趣者可以试一试。
不过有一点是可以肯定的，这样的启动方式往往会被木马或一些恶作剧程序（如，妖之吻）利用而导致系统的不正常。由于一般用户很少会对这两个文件关心，甚至有的人不知道这些文件是做什么用的，所以隐蔽性很好。但由于其使用的越来越频繁，这种启动方式也被渐渐的察觉了。用户可以使用msconfig这个命令实现检查是否有什么程序被加载。具体的是在看是菜单中的“运行”中输入msconfig回车，之后按照文字说明即可。
注意：
1.和WIN.INI文件不同的是，SYSTEM.INI的启动只能启动一个指定文件，不要把Shell=Explorer.exe file.exe换为Shell=file.exe，这样会使Windows瘫痪！
2.这种启动方式提前于注册表启动，所以，如果想限制注册表中的文件的启动，可是使用这种方法。
3.WININIT.INI启动：
Wininit.ini这个文件也许很多人不知道，一般的*作中用户也很少能直接和这个文件接触。但如果你编写过卸载程序的话，也许你会知道这个文件。
WinInit即为Windows Setup Initialization Utility。翻译成中文就是Windows安装初始化工具。这么说也许不明白，如果看到如下提示信息：
Please wait while Setup updates your configuration files.
This may take a few minutes...
大家也许就都知道了！这个就是